una vacuna de ARNm que redujo el cáncer de su perro – La nación

Paul Conyngham no es biólogo. Tampoco es veterinario. Es un ingeniero radicado en Sydney con casi dos décadas de experiencia en ciencia de datos e inteligencia artificial. En 2024, su perra Rosie recibió un diagnóstico terrible: tenía cáncer de mastocitos, el cáncer de piel más común en perros y prácticamente intratable con métodos convencionales. Después de intentarlo todo, Conyngham decidió tomar una ruta alternativa: abrió ChatGPT y empezó a hacer preguntas.

ChatGPT como punto de partida. El modelo de IA de OpenAI actuó como asistente de investigación de Conyngham. Le ayudó a desarrollar un plan en un área sobre la que no tenía absolutamente ningún conocimiento y fue el chatbot el que le sugirió que buscara tratamientos de inmunoterapia. También señaló e inició la existencia del Centro Ramaciotti de Genómica de la Universidad de Nueva Gales del Sur (UNSW). un viaje fascinante.

$3,000 para secuenciar un tumor. En este centro de investigación en Conyngham han hecho contacto con el profesor asociado Martin Smith, uno de sus líderes. Conyngham pagó 3.000 dólares para secuenciar el ADN del tumor de Rosie, lo que a Smith le pareció extraño: normalmente no apoyan la secuenciación que los individuos desean porque interpretar los datos es extremadamente difícil. Pero Conyngham le aseguró que no tenía nada de qué preocuparse y le dijo que era analista de datos y que los analizaría usando ChatGPT.

De ChatGPT a AlphaFold. Con estos datos de secuenciación, Conyngham utilizó varias herramientas de inteligencia artificial (no solo ChatGPT) para identificar las mutaciones relevantes. Luego fue un paso más allá y utilizó AlphaFold, el programa DeepMind de Google que predice la estructura tridimensional de las proteínas. Esto le permitió modelar cuál de estas mutaciones podría desencadenar el tumor. Usó estos datos para identificar posibles medicamentos que podrían ayudar a tratar el cáncer y los presentó a los investigadores de la UNSW con su tarea terminada.

Primer obstáculo: la burocracia. El equipo de investigación identificó un fármaco de inmunoterapia prometedor, pero su fabricante se negó a suministrarlo para este tipo de aplicación. Fue un duro golpe para Conyngham, pero luego Smith le habló de las vacunas de ARNm y le preguntó si quería explorar esa vía. “Por supuesto”, dijo Conyngham. De hecho, producir la vacuna era sólo la mitad de la batalla, ya que su administración requería una aprobación ética, que permite realizar experimentos en seres vivos. Después de preparar un documento de 100 páginas durante los dos meses siguientes, Conyngham recibió esta aprobación.

Vacunas en dos meses. Un departamento de la UNSW dirigido por el profesor Pall Thordarson produjo la vacuna utilizando la media fórmula desarrollada por Conyngham. Sólo necesitaban encontrar a alguien que se lo administrara, y así fue como Conyngham logró ponerse en contacto con Rachel Allavena, profesora de inmunoterapia canina en la Universidad de Queensland. Viajó diez horas con Rosie y se presentó para recibir su primera inyección en diciembre.

El tumor se redujo a la mitad.. Investigadores de la UNSW y la Universidad de Queensland han confirmado que uno de los tumores de Rosie se había reducido a la mitad. Allavena explicó que el brillo de su pelaje también se había recuperado y la perrita parecía más feliz y saludable. Conyngham lo confirmó: su perro estaba perdiendo energía, pero seis semanas después del tratamiento estaban en un parque y Rosie saltó la valla para perseguir a un conejo que había visto.

Pero. Aunque la historia es extraordinaria, no existe una cura completa y milagrosa aquí (por el momento). Uno de los tumores respondió a la vacuna, pero otro tumor más grande no. Además, no hubo estudios controlados ni tamaños de muestra más allá de un animal ni datos a largo plazo. El propio Conyngham comentó: “No me hago ilusiones de que esto sea una cura, pero creo que este tratamiento ha mejorado significativamente el tiempo y la calidad de vida de Rosie”.

Y Conyngham no es un hombre común y corriente.. También es importante señalar que Conyngham tenía un perfil muy especial: sus 17 años de experiencia en ciencia de datos y aprendizaje automático (aprendizaje automático) fueron cruciales para el progreso de su investigación. Su conocimiento técnico permitió a la IA avanzar hacia un campo que él no conocía pero que podía entender, y el chatbot y otras herramientas aceleraron el proceso. Pero quienes finalmente lo hicieron posible fueron los inmunólogos, ingenieros de ARN y oncólogos veterinarios involucrados en el proceso.

¿Esto también funciona en otros casos? Smith hizo una pregunta lógica después de este éxito único. “¿Por qué no introducimos esto para todas las personas con cáncer?” La respuesta corta es clara: los ensayos clínicos toman años, cuestan cientos de millones de dólares y requieren evidencia clara, que en este caso es simplemente cero. Uno de sus colegas, David Thomas, ya está trabajando en tratamientos similares de ARNm para pacientes humanos y cree que hay algo revolucionario aquí: “Lo que destaca es la idea de la ciencia ciudadana, donde alguien de la calle con un perfil técnico puede aplicar sus habilidades al proceso científico”.

La segunda vacunación ya está en marcha. Este proceso ha demostrado que es posible acortar drásticamente el tiempo entre la idea y el tratamiento experimental. Thordarson señaló que el logro de Conyngham (generar una fórmula de ARNm sin formación en biología) muestra que la IA está ayudando a democratizar este proceso. De hecho, el trabajo aún no está completo: la UNSW ya está trabajando en la secuenciación genética del tumor que no ha respondido al tratamiento, y el objetivo es desarrollar una segunda vacuna dirigida precisamente a tratar este tumor.

Imagen | Ed Oswalt

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